Областная клиническая больница была образована 4 января 1952 года приказом №2 по Семипалатинскому Губернскому отделу здравоохранения на базе физинститута, хирургической и глазной больниц. Она имела в своём составе 8 стационарных отделений на 305 коек, 3 терапевтических отделения, хирургическое, глазное, ЛОР, стоматологическое и неврологическое. К больнице были приданы 2 поликлиники с 11 врачебными участками подсобно-диагностическими отделениями.

Сегодня Медицинский Центр является крупнейшим многопрофильным лечебным, учебно-педагогическим учреждением в Республике. В составе центра 15 стационарных отделений на 510 коек, оказывающих 31 вид специализированной помощи. Поликлиника — где ведётся приём по 29 специальностям. 12 подсобных лечебно-диагностических подразделений. Отделения и подразделения Медицинского Центра оснащены современным, высокоэффективным оборудованием и аппаратурой. Только в 2001 году в рамках гуманитарной помощи правительством Японии было предоставлено медицинское оборудование на сумму более 220 миллионов тенге – в том числе газовые, электролитные, гематологические анализаторы, эндоскопы, новейшая рентгенодиагностическая и ультразвуковая аппаратура.

С 1999 года в Медицинском Центре работает кабинет телемедицины. В нём проводятся ультразвуковые исследования с пункционной биопсией щитовидной железы и через спутниковую систему связи осуществляются консультации, обмен информацией со специалистами из университета г.Нагасаки в Японии.

В Медицинском Центре широко внедрены современные методы малоинвазивной хирургии и гравитационной детоксикации при системных поражениях соединительной ткани.

В больнице работает 858 сотрудников, в том числе 161 врач, 334 сотрудника среднего медицинского персонала. Из 161 врача 55% аттестованы на квалификационную категорию, 47 врачей имеют высшую квалификационную категорию. Среди медицинских сестёр 50% имеют квалификационную категорию, из них 69 — высшую. 5 врачей имеют учёную степень кандидата медицинских наук. Готовятся на защиту 3 кандидатских, 2 докторских диссертации.

На базе Медицинского Центра находятся 11 кафедр Семипалатинской государственной медицинской академии.
65 сотрудников медицинской академии, в том числе 6 профессоров и 15 доцентов, успешно совмещают учебно-педагогическую деятельность с лечебной. В течение года совместно с работниками кафедр выпускается 20-30 научных статей и публикаций, внедряется около 50 новых методик диагностики и лечения больных.
Ежегодно свыше 15 тысяч жителей области получают специализированную помощь в стационарных отделениях, проводятся более 4,5 тысяч операций. Более 50 тысяч жителей получают консультативную помощь в поликлинике. Внедрение в практику современных методов диагностики и лечения, медико-экономических стандартов 1999 года позволило эффективно использовать коечную сеть и значительно сократить сроки пребывания больных в стационаре.

Совместными усилиями научно-технического потенциала Медицинской Академии и практического опыта Медицинского Центра достигнуты значительный подъём качества и уровня медицинской помощи населению. В 2002 году Медицинский Центр впервые участвовал в республиканском тендере и получил квоту на оказание высокоспециализированной помощи, финансируемой из республиканского бюджета.

В 1953 году открывается первый ЭКГ кабинет в области. В 1959 году открывается ортопедотравматологическое отделение.

В 1967-1970 годах на окраине города был построен новый комплекс зданий областной клинической больницы.
В 1969 году стали решаться вопросы специализации коечного фонда, приближения медицинской помощи к сельскому населению, совершенствования методов диагностики, налаживается консультативная работа, совершенствуется организационно-методическая работа, улучшается обеспеченность врачебными кадрами.
В 70-е годы больница превратилась в крупнейшую многопрофильную специализированную клинику области. Были открыты отделения нейрохирургии, урологии, кардиохирургии, реанимации и интенсивной терапии. Коечная мощность достигла 600 коек.

В 80-е годы были открыты новые отделения и службы: эндоскопическое, гипербаротерапии, кардионефрологическое, отделение гемодиализа. Внедрены новые методы лечения ревматологических больных: лазеротерапия, магнитотерапия, гемосорбция.

В 90-е годы система здравоохранения перенесла сложный переломный период. В эти годы от клиники отделились и стали самостоятельными учреждения: центр реабилитации инвалидов, глазной и почечный центры, инфекционная больница, патологоанатомическое бюро.

Закрытие полигона, объединение двух областей, внесли свои коррективы в задачи, стоящие перед лечебными учреждениями региона. Возникла актуальная проблема реабилитации населения, пострадавшего от последствий ядерных испытаний, подготовки врачебных кадров в новых условиях. Для решения этих задач взрослая и детская областные больницы в 1999 году были объединены и преобразованы в Клинический Учебный Центр Семипалатинской Государственной Медицинской Академии с приданием статуса Центра Реабилитации Населения Восточно-Казахстанской области.

С 1999 года в Медицинском Центре работает кабинет телемедицины. В нём проводятся ультразвуковые исследования с пункционной биопсией щитовидной железы.